反物质的陨石撞击地球
1948年，美国天文学家林肯·拉·帕扎提出反物质假说，认为是一个含有反物质的陨石撞击地球造成大爆炸。
黑洞说
1973年，美国物理学家艾伯特·杰克逊和迈克·赖恩提出“黑洞学”，认为通古斯陨石其实是一微型黑洞，从西伯利亚贯穿了整个地球。另外，一些科学家试图诉诸于地球本身的因素。有人认为岩层裂缝逸出的沼气大规模聚集，最终引起爆炸。有人则认为是特大闪电造成大爆炸。更有人大胆猜测，大爆炸系地球人所为，是美国物理学家特斯拉在进行远程无线能量转换系统实验时，不慎计算失误而酿成的大祸。
自燃现象
另外有一些学者认为通古斯大爆炸是地球本身产生的自燃现象，例如地下可燃气体集中爆发假说，也有人认为是一颗巨型球星闪电击中通古斯，人们误以为是大爆炸等等。2004年7月，俄罗斯科学家尤里·拉夫宾等人在爆炸地区附近发现了两块奇怪的黑色石头。
