之后这份手稿在同时代的几位科学家手中辗转，他们得出结论，这是某种语言，不过他们并不清楚它的具体含义。亚利桑那大学的一个科研组最近对该手稿进行了深入研究，他们从负责保管伏尼契手稿的耶鲁大学百内基珍本书图书馆提供的4个样本页上切下4块宽1毫米，长6毫米的片段。其他专家也对这位神秘作者使用的颜料和墨水进行了研究。亚利桑那大学物理学系的助理研究员和副教授格雷格·霍德金斯博士负责领导了这个项目，他表示，他们发现手稿中使用的一些颜色与文艺复兴时期使用的颜色相符。但是对这项研究起到关键作用的还是碳测年过程，科学家对放射性同位素碳14的数量进行了测量，这种物质在物体中自然产生，并以特定速率发生衰变，因此通过对其数量进行测量，可以准确测定其形成的年代。
霍德金斯通过碳测年法确定伏尼契手稿写成于15世纪初。他说：“我发现该手稿非常有魅力，它是进入一种有趣思维方式的窗口。把这些片段组合在一起将非常奇妙。这是一个无人破解的谜题。它是一种密码吗？人们正在对其文字和词的使用进行统计分析，这些工具是用来破解密码的。不过科学家至今仍未揭开这个手稿的谜底。” 霍德金斯表示，他发现手稿显示出“奇怪特征，例如重复使用一个词或者交换字母的顺序”。
他说：“这种奇怪现象使我们更难弄懂这份手稿的含义。没人知道该手稿写的是什么内容，不过它显然与炼金术有关。难解之谜有时与炼金术有关，因此，如果这本书里的内容是用密码写成的，它一定也与炼金术有关。手稿上有很多图画。这些图画与植物学有关吗？它们是水生生物吗？这些图片是否与占星术有关？没人知道答案。”
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