2014年根据巨口鲨的尺寸和深度分布预测，它们正受到明显的渔业威胁，面临灭绝的风险升高。有证据表明，巨口鲨在台湾被刺网渔业捕获频繁，而且2015年已经在菲律宾和斯里兰卡屡被捕获。
捕捉巨口鲨的记录
人类捕获第一条巨口鲨
1976年11月15日，美国水文地理考察船“MBC”号完成了对夏威夷群岛北部深4800米水域的考察后，在往回拉一个伞状防坠器时意外捕获了一只长4.5米，重750公斤的特大的鱼，而且它居然有一个宽1米的大口。这是人类发现的第一条巨口鲨，一条雄性巨口鲨。它被保存在火奴鲁鲁博物馆，属于一个鲜为人知的鲨鱼族群。
第一条雌性巨口鲨被捕
直到1994年11月，终于有一条雌性大嘴鲨在日本九州岛福冈市的海岸被发现，不到2小时，CNN便像世界展示了这条长达4.8米，重800公斤。经赶到的美国专家鉴定，这是一条从未生育过的大嘴鲨，卵巢只有3毫米大，看来还在发育中。
中国的巨口鲨记录
截止2011年全球有发现记录的也只有50只。2006年3月中旬浙江省乐清县岐蒲镇渔民在中国东海南部(靠近台湾北部)海域捕获一条体长4560mm的鲨鱼。经鉴定为巨口鲨，为中国大陆沿海鲨鱼新纪录种。 也是全世界有发现记录的第36条。2006年3月26日此巨口鲨运往浙江省温州市鹿城标本工艺厂 , 并制成标本。
