经考古发现，哈民忙哈遗址房屋居址平面成排或成组分布，一般呈东北—西南走向，门道朝向一致，为东南向，排列比较整齐。房址都是半地穴式，平面呈“凸”字形，有长方形门道和圆形灶坑。面积多在10-40平方米不等。穴壁存高0.1-0.9米。门道多呈长方形，门向集中在130°至140°之间。灶坑位于居室中部偏南，平面多为圆形，斜壁平底，内部包含大量的灰烬和兽骨渣。居住面及四壁多经过烧烤，呈红褐色，居住面局部发现柱洞。居住面上普遍散布有遗物，包括生活用具、生产工具以及装饰品等。生活用具多为陶制品，如罐、壶、盆、钵等盛储器。生产工具一般常见有石制品，如磨盘、磨棒、斧、锛、凿、杵、锄及球等实用器。装饰品多见骨、蚌器和玉器。
其中有7座房屋因火烧后完整或局部的保存了房屋顶部的木质构架结构痕迹。清晰地显现了房屋顶部的原始形状。考古清理结果显示，屋顶是由柱、檩、椽等呈层捆绑、咬合形成坡状的爬梁式屋顶。此外，还有3座房址颇为奇特，房内出土有大量人骨遗骸，其现象极其惨烈，可能是瘟疫造成的大量人员死亡，导致集中弃尸或抛尸，遗骸呈现出凌乱、破损和焚烧等迹象。其中40号房址内可辨识不少于97具人骨遗骸，骨骸部分有火烧痕迹。散乱的骨骸迹象说明埋葬过程的仓促与简单。展示了遥远的史前年代这里的一场杀戮或瘟疫，经鉴定发现房址内尸骸多为女性和儿童，男女比例明显失衡，这对解释聚落的废弃原因有巨大意义。
