对于木村政昭的猜测，其他考古学家进行了反驳。加拿大英属哥伦比亚大学东亚考古专家理查德-皮尔森认为，与那国岛出土的文物表明那里的人类文明可以追溯到公元前2000到2500年。当时，那里的人类群体非常小，不可能拥有如此非凡的能力建造这些巨大的石材结构。而且台湾距离与那国岛很近，虽然台湾人民那时已经开始用石头建造房屋，但在台湾也没有发现任何与与那国岛相似的证据。
不管专家们如何辩论，但这些巨大的神奇结构确实存在。在今天，即使不用专业的潜水设备，人们都可以很容易看到这些鬼斧神工般的岩层。无论是天然之城也好，还是沉没的远古文明也好，这片水下奇迹留下的众多谜团吸引了世界各地大批游客和考古爱好者的猎奇。
水下怪石圈
3. “农业生产革命遗址”--以色列亚特利特雅姆古村落
在以色列海法附近的地中海海域中，距离岸边大约一公里的位置，那里沉没着一个古老的村庄。这座古老的村庄如今在水下保持完好，大量的象鼻虫躲在村庄的粮仓中，人类的骨架平静地躺在各自的坟墓里，一个神秘的怪石圈仍然站立在那儿，就像当初刚刚被竖立时一样。
这个水下村庄就是亚特利特雅姆古村落。亚特利特雅姆古村落大约存在于公元前7000年前，面积约为4万平方米，是目前已发现的最古老的沉没定居点。那里没有规划完整的街道，因此考古学家将其定位为村庄，而不是城镇。不过在这个古村落中，人们居住的是大型石头房屋，房屋中有铺砌的地板，家中有庭院、有壁炉，还有存储设施。
这个水下村落被淹没了长达9000年时间，直到1984年以色列海洋考古学家埃胡德-加利利首次发现它。从1984年起，加利利每年冬天都会潜入水下对这个村落进行考察。通过该村落，人们对新石器时代的人类生活有了更深入的认识。加利利解释说，“从该村落遗址看，当时的人们正经历人类历史上最伟大的一次革命。”
