多尔衮进军北京，多尔衮把年幼的顺治帝以及朝廷由东北的盛京迁都至北京，清定都北京后封吴三桂为平西王。
清定都北京后封吴三桂为平西王
处死永历帝，为日后埋下隐患
投降清朝后，吴三桂还是跟清朝保持一定的距离，但是随着形势的发展，吴三桂的思想开始发生变化，彻底投入到清朝的怀抱，在清朝命令他镇压南明势力的时候，吴三桂不遗余力的残酷镇压南明义军，甚至会屠城。
顺治十六年（1659年），吴三桂攻下云南。 攻下云南后，即委其开藩设府，镇守云南，总管军民事务。攻下云南之时，当时洪承畴也在，吴三桂便询问洪承畴如何能够永镇云南。洪承畴的回答就是如果要永镇云南，不能去缅甸，不能杀死永历帝。
吴三桂与清政府的矛盾尖锐
这很好理解，只要永历帝在缅甸，西南边陲就无宁日，需要大将牵制，而吴三桂的重要性就体现了，但是永历帝如果死了，那么就会飞鸟尽，良弓藏了。不过吴三桂并没有听取意见，或者说没能阻止这种行为，顺治十八年（1661年），师出缅甸，用弓弦将永历帝杀死在昆明。
永历帝一死，清朝再无威胁，于是吴三桂与清政府的矛盾尖锐，终于爆发了后来的三藩之乱，最后被康熙平定。
可以说吴三桂一生都在趋炎附势，以自己的利益为重，完全不顾国家大义，所以在历史上无论是清朝还是明朝还是现在，都没有好的评价，总结起来就是两个字：汉奸
