24个石窟，开凿出的石料估计会有8万立方米，都运到哪里去了?洞中有鸟、马、鱼的石雕图案和闪电状刻纹，表达什么意思?石窟的数量究竟有多少个?石窟曾是石背山上的明代古刹竹林禅寺的放生池，放养了许多鱼鳖，为何将水抽干之后不见一条鱼或鳖，难道它们都土遁了不成?……
然而，如此庞大的工程，史书、方志以及典籍均无任何记载，连民间传说也没有，为何保密工作做得如此之好?
经过众多的考古专家和研究者仔细辨认和各种资料的综合分析，就目前掌握的素材，要断然得到结论，还为时过早，准确的答案还有待于石窟彻底的发掘和全面的考察。不过有几点是可以肯定的。
考古得知
1、龙游石窟不是自然形成的溶洞。
浙中地区是丘陵地带，据考证，在距今约三亿至二亿五千万年以前，即地质年代的晚古生代石炭纪与二叠纪时期，这里曾经是一片汪洋。随沧海桑田的变化，浙中地区地壳发生了强烈的造山运动，地壳抬升隆起，产生褶皱和断裂。造成该地区多溶洞的地形。
龙游石窟不是自然形成的溶洞
例如金华的双龙洞、冰壶洞、朝真洞、兰溪的地下溶洞等。但是很明显，龙游石窟根本区别于以上的溶洞。
