曹操想了想说：“家唯一，民为众，国为首。当然是民事、国事大。”“那么丞相留我为您一个人治病，而天下战火横飞，灾难迭起，万民涂炭，不知道有多少人无医少药而命丧黄泉。如今家事、民事、国事都摆在这里，不知道丞相有何见解?”曹操听到这里，明白了华佗的用意，沉思了半晌说：“我留你，只是为了家事，而忘了民事，国事。好吧，我马上放你走，不过在你走之前，能不能找出一种能治我这头痛病的长效药呢?”
华佗觉得曹操的话也不过分，回到自己的帐篷后，他没有马上走，而是日夜翻书查找资料，终于在自己祖父记载的秘方里找到了一种能治头痛病的药方。只是这种药房里有一味药，是地下棺木中的死尸身上长的一种小虫，名叫僵虫。这种虫子有剧毒，稍有半点不慎，就会使人中毒身亡。
所以，华佗的祖父的秘方上批复写：禁用。华佗决定用这个药方给曹操治头痛病，他仔细的根据药方配好药，自己亲自煎熬。等药煎好以后，他担心曹操中毒，就自己先到了一小碗，想喝了试试，看看有什么反应。哪知道药刚服下不久，他就满腹钻心疼痛，站立不稳倒在地上。华佗知道自己中了毒，等他叫人喊来曹操的时候，已经不能说话，用脚踢翻了药罐子，意思是叫曹操不要服用此药。没过多长时间，华佗就断气了。
曹操见华佗是为了自己尝药中毒而死，不禁放声大哭：“先生神医，是我害了你啊!我不该问你要长效药方!”随后曹操又下令用重礼厚葬了华佗，还追封华佗为医圣德师，俸三品薪，对华佗的妻子家眷，也一一拨薪安置。因为华佗是在曹营里死的，曹操哭华佗的时候又说： “是我害了你”，一些不明底细的人、特别是那些对曹操不满的人，便说华佗是曹操杀害的。如果是综上所言，那曹操实在是冤枉了。
