然而，木村政昭认为这些建筑结构大约建造于6000年前，当时这个古老的城市还处于海平面之上。最近，木村政昭又宣称这些建筑结构可能建造于3000到2000年前，因为当时的海平面已接近20世纪的水平。后来，由于地质运动，导致这片土地沉没于海水之下。
对于木村政昭的猜测，其他考古学家进行了反驳。加拿大英属哥伦比亚大学东亚考古专家理查德-皮尔森认为，与那国岛出土的文物表明那里的人类文明可以追溯到公元前2000到2500年。当时，那里的人类群体非常小，不可能拥有如此非凡的能力建造这些巨大的石材结构。而且台湾距离与那国岛很近，虽然台湾人民那时已经开始用石头建造房屋，但在台湾也没有发现任何与与那国岛相似的证据。
不管专家们如何辩论，但这些巨大的神奇结构确实存在。在今天，即使不用专业的潜水设备，人们都可以很容易看到这些鬼斧神工般的岩层。无论是天然之城也好，还是沉没的远古文明也好，这片水下奇迹留下的众多谜团吸引了世界各地大批游客和考古爱好者的猎奇。
帕夫洛彼特里古城墙
7. “荷马时代港口”--希腊帕夫洛彼特里
当年，特洛伊战争中或是《伊利亚特》和《奥德赛》史诗中的勇士们登船远征的时候，他们或许就是从帕夫洛彼特里港口出发。希腊帕夫洛彼特里市应该是已知最早沉没的城市。英国南安普敦大学海洋地质学家尼古拉斯-弗莱明于1967年潜入该海域发现了这片古城遗址。弗莱明认为，“帕夫洛彼特里最适合作为中转站。”
