本次研究得到了很多支持：华盛顿州立大学的分子人类学家Brian Kemp 提供了科罗拉多和英属哥伦比亚地区古家狗的新DNA样本；伊利诺伊州立考古勘探研究所(ISAS)提供了伊利诺伊州南部Janey B. Goode出土的35个样本。Janey B. Goode靠近圣路易斯，在古城Cahokia附近，是北美第一个被发现也是最大的古城遗址，那儿人类活动大约在1000-1400年前比较活跃，而Cahokia的人类活动则活跃于700-1000年前。
科学家在Janey B. Goode发现了几十只被隆重安葬的家狗，这表明当时人们对于狗有一种特殊的尊敬。这里的大部分狗都被单独安葬，但也有背靠背成对安葬的。而在Cahokia，情况却发生了变化，狗的遗体有时是和食物残迹一起发现的。这表明Cahokia虽然有狗，但当地人却吃狗。此外，这个时期的狗葬也非常罕见。
科学家之前对美洲古家狗的研究都集中在线粒体DNA，根据Witt的解释，主要有两个原因。第一，相比细胞核DNA，更容易从狗的遗骸获得线粒体DNA。第二，不同于细胞核DNA，线粒体DNA只能从狗妈妈那遗传。这就意味着线粒体DNA给科学家提供了“从现在到过去的完整遗传链”。
由于上述原因，本次研究也集中于线粒体DNA，但分析的样本数量却史无前例。Witt和Malhi领导的小组通过分析美洲古家狗的线粒体基因组，确定了狗的基因多样性以及特定区域的亲缘程度。爱荷华大学的人类学教授Andrew Kitchen对完成这项工作做出了重要贡献。
通过上述基因分析，科学家发现了4种以前从未记录的古家狗基因类型，这说明美洲古家狗的多样性比之前认为的要丰富。在有些家狗种群中，科学家发现基因多样性程度非常低，这说明人类干预了狗的繁衍过程。此外，有些古家狗样本的基因和美洲狼基因的非常相近，这说明古家狗和美洲狼之间存在杂交，有些家狗甚至就是由美洲狼驯化而来的。
研究虽然获得的很多成果，但Witt表示，整个研究最让人吃惊的部分还是它一定程度上确定了狗到达美洲的时间、方式等信息。研究也表明美洲家狗的基因多样性可能只能追溯到10000年前。
Malhi教授说补充说，狗在美洲出现的时间和美洲发现的最古老的狗葬时间相同，可能并不只是巧合。他还说，由于当前的研究只使用了很少一部分线粒体基因组，所以很可能只提供了美洲古家狗多样性的不完整蓝图。同时，被测序线粒体基因组存在地域局限性，可能会掩盖了美洲土著狗的基因多样性，从而得出美洲狗的出现时间比人要晚的结论。
