近年来，最引人关注的是科学家提出的“生态危机论”。我们知道，玛雅文明主要是建立在以玉米为农业基础之上的，它的盛衰与玉米的收成息息相关。
由于对生态环境知识的缺乏，当时的农民采用一种极原始的“米尔帕”耕作法，即他们把树木砍光，进而焚毁，将草木灰用作肥料，烧一次种一荏。休耕1~3年后，待草木长得比较茂盛之时，再烧再种。如此年复一年，日复一日。
随着人口的增长，人们大片地毁林开荒，同时把休耕时间缩短，这导致土壤肥力下降，玉米的产量也越来越少。这样，连供人们食用的粮食都成了问题，其他的发展就更谈不上了，因此，玛雅人的社会状况随之一落千丈。
而玛雅王族和祭司并未意识到这一点，他们将种种“衰败之象”都归结为神的不满。为了期盼得到神的帮助，他们要求建造更多的神庙。殊不知，这样会浪费更多的人力和资源，进而让社会陷入不可救药的恶性循环之中。种种迹象表明，因种种原因带来的资源短缺是玛雅人弃城的直接原因。
