老和尚声称无有，十数名大汉对老和尚施以毒打，先用木棒，继用鈇棍，打的头面流血，肋骨折断，随打随问，这一天打了四次之多。老和尚闭目不视，趺坐入定，大汉等以为死了，呼啸而去。这时老和尚身边唯有侍者法云、宽纯在身边，老和尚端坐九日，至三月十一日(即四月十六号)渐倒下作吉祥卧，侍者以灯草试鼻管，已没有气息，唯颜色如常，身体尚温。到十二日早上，老和尚发出了微弱的呻吟声，睁开了眼睛。侍者告以时间，老和尚说：“我觉得才数分钟”。
这时老和尚所受的受楚毒，伤痕并发，病势日增，目不能视，耳朵重听。身边的弟子怕发生意外，促请老和尚口述生平事略，由弟子记录下来，辑为年谱草稿。虚云老和尚口述事变之始末，由弟子笔录，并秘密书写于‘诸经日诵’之内页里层(线装书之内层)，后由——香港辗转送回国内，大陆政府高层李济深副主席和周恩来总理等，始知此一迫害宗教之事件。该书现藏于台湾国立历史博物馆。
三、云门事件的悲哀
“云门事变”使人想起“新闻自由”的问题，如果当时虚云老和尚的社会环境，新闻报导自由，不受政党干预或控制，就不需要将事情真相“秘密书写……由香港辗转送回国内”了。一件发生在国内的大事，竟要辗转由外地才能送回“国内”发表，真是这个国家的悲哀!如果一个社会的传媒沦为政党的传声筒，新闻无法自由报导，受害的将会是人们(当然也包括佛教徒)，因为正义无法伸张，真相无从揭露。
