直到核武竞赛才推翻了此一正统理论。20世纪80年代，美国将密封的放射性废弃物罐子里在地下。美国能源部有关当局担心，如果地下深处存在着微生物，那么它们可能会消化掉这些密封罐。1987年，为了解除此一恐惧，美国能源部赞助了一支研究小组寻找美国南卡罗来纳州萨凡纳河流设施下方、小口径小井里存在的生命。
出人意料的是，科学家在地下500公尺深处发现了细菌和名为古生菌的单细胞有机物。随后科学家发现，地下生命不仅存在，而且非常普遍。
1992年，英国卡迪夫大学的约翰帕克斯(JohnParkes)在日本海域发现沉积物里充满了各种生命体。即使在海底500公尺深处，他们在每立方公尺的泥土里也发现了1100万个微生物。
这其中蕴含的意义非同寻常。即使你考虑到地球内部散发出的热量会杀死地下4000公尺深处的任何生命，它仍然存在足够的空间供大量生命存活。
初步估计地下所包含的生命大约佔全世界生物量的1%至10%，对地壳更详尽的探索将进一步确定这一数值。
同时，研究重心已经转移到回答其中某些最紧迫的问题，也即深埋地下的有机物所面临的挑战。名单之首的问题便是牠们在如此贫瘠的环境里是如何进食的?例如，生活在海底地下的微生物，在几千年前被埋葬在地下沉积层之前，一定是起源于海底。周围泥土只有较少量的营养物质，没有任何新鲜的食物源，微生物早已经极度饥饿。
的确如此，考虑到透过显微镜观测到这些微生物表现出怪异的静止状态，有些怀疑论者辩称这些是完好保存的长期死亡的细胞尸体，而非活的有机体。
然而，这并不是日本南谷日本海洋地球科技署的诸野祐树(YukiMorono)所发现的结果。他的研究小组利用日本附近太平洋海底220公尺深处，发现了有46万年历史沉积物里的细胞样本，并为它们标记着有稳定的碳和氮同位素的充足食物源。两个月之后，诸野祐树在四分之三的细胞样本里发现了同位素的痕迹。
