舒尔哈齐只有归来，请安谢罪道：“兄汗优养恩深，弟却妄想赴别处居住，实乃大谬大错了。”
努尔哈赤并不多言，大度赐还没收的舒尔哈齐全部家产。
在他人眼中，努尔哈赤是顾念手足之情。
在舒尔哈齐看来，努尔哈赤是故作姿态。
他不感恩。他认为自己没有理由感恩，反而应该牢记哥哥对待亲弟弟的刻薄寡恩！
努尔哈赤何尝感觉不到这些？
舒尔哈齐完了。他永远不再是弟弟，而是敌人，一个无用、有害，又再无必要与之周旋的敌人。
努尔哈赤佯称新宅落成，邀舒尔哈齐赴宴，将其幽禁。又以舒尔哈齐之命召来他的两名心腹骁将常书、纳齐布，在二人步入房门之时，使潜伏甲士拦腰斩杀之。
舒尔哈齐铁索锒铛，被囚禁在暗无天日的禁所，囚室门窗皆被砖石密封，仅留“通饮食、出便溺”两个洞口，生不如死。两年后，亦即万历三十九年(1611年)八月十九日，舒尔哈齐忧愤而亡，时年四十八岁。
努尔哈赤大权在握，于明万历四十四年元旦，顺利登上了后金天命汗的宝座。
五十八岁的努尔哈赤，以吞吐天地的雄才大略，横扫千军的赫赫战功，统一女真的光辉业绩，赢得了此时的殊荣。而他光辉灿烂的宝座，染有其胞弟——舒尔哈齐的血。
舒尔哈齐死于女真上层权力与汗位的争夺。关于他的死，有各种不同猜测。除一些猜测认为他是被努尔哈赤囚禁、“忧愤而死”外，更多的猜测则认为他是被努尔哈赤杀死的。
清朝官书隐去了努尔哈赤囚禁舒尔哈齐的情节，含糊记载道：
