第三种办法则是英国牛津昆虫技术公司(Oxitec)推出的“以蚊灭蚊”计划，即向野外释放用转基因培育出的有精但不育的雄蚊。这种雄蚊的后代体内的一种酶会积累到有毒的浓度，导致幼虫大量死亡。牛津昆虫技术公司的科学主管洛加·奥菲指出，他们的这种转基因蚊子不会对生态系统形成长期的改变，因为它们的寿命很短——只能成活一代，而且没有后代。
如今，巴拿马、墨西哥、马来西亚、开曼群岛等蚊子肆虐的地方已经开始进行转基因蚊子的野外放生实验。很多科学家对此持支持态度——因为喷洒化学杀虫剂，会对所有生物都带来影响，可能会让整个生态系统受到损害。美国宾夕法尼亚大学生物和昆虫学教授安德鲁·里德教授就认为，培育变异蚊子控制蚊子数量，可能是控制登革热最安全的现实方法；如果无差别地喷洒杀虫剂，那么整个生态系统都会受到影响。
如果蚊子全灭绝了
然而蚊子已经在地球上存在了上亿年，并与多种物种协同进化。从生物多样性的角度而言，我们是不是真的该“消灭”蚊子？
正如我们前文所说，大多数蚊子的成虫是靠吸食花蜜为生的——它们和蜜蜂一样，也是植物的授粉者。美国罗格斯大学新布朗斯维克分校的进化生态学家迪娜·丰塞卡用几种会叮人的蠓科蚊子，也就是我们常说的“蠓蠓蚊”举例说：鉴于有几种蠓是可可树等热带作物的授粉者，“消灭它们可能造成一个没有巧克力的世界”。
同时，在自然界的食物链中，蚊子也是很重要的一环。美国密歇根州立大学的水生昆虫学家理查德·梅里特说：“蚊子是美味佳肴，而且很容易捕捉。”倘若蚊子灭绝了，它们的幼虫孑孓消失了，那么有好几百种鱼就必须改换食谱才能生存了。美国北卡罗来纳环境与自然资源厅的昆虫学家布鲁斯·哈里森说：“这听起来容易，但像摄食行为这样的性状是从基因上深植于这些鱼类之中的。”例如食性特化的食蚊鱼(Gambusia affinis)。作为灭蚊高手，它们通常被养在稻田或游泳池里来防治害虫，要是没了蚊子就有可能会灭绝。受影响的不仅仅是鱼类，还有很多种类的昆虫，以及蜘蛛、蝾螈、蜥蜴和青蛙等等。
