不过制作单位没想到，神奇宝贝当时是轰动全日本的动画，观众中有许多眼睛比大人敏感的青少年。加上儿童喜欢不眨眼盯著电视看，而红光跟蓝光(最为刺激人眼)快速切换的速率又高达1/12秒一次，於是在上面剧情中的※处，视神经受到强烈刺激，影响到脑部的控制，轻则不舒服，重则会昏厥或痉挛。这以往不被重视的「光过敏症」，因为这事件而在医学界开始大力研究，并也促成新的动画制作规则。
3d龙事件后神奇宝贝更加火爆
在第38集出问题後，东京电视台以及日本各地电视台决议，在制订新的动画制作规则前先停播神奇宝贝以避免恐慌。在同一时间内也为忍者乱太郎等多部采用闪烁技术的动画进行大幅度的减光处理，防止另一波的光过敏事件。
之後由於承袭了更安全严苛的制作规则(禁止使用强光闪烁技术与高色差背景)，加上神奇宝贝热反而烧得更旺，於是在含当时送医的观众也强烈希望再度看到神奇宝贝的声浪下，东京电视台在隔年4月16日换到现在的时段复播了。
原本是第39集「迷唇姐的圣诞节」转进特别篇，新的39集改成动人心弦的「皮卡丘的森林」，收视率居高不下。虽然之後至今为了避嫌，3D龙以及其进化型「3D龙2」都没办法在神奇宝贝动画里登场了，但神奇宝贝不仅扮演了研究此症状的先驱，还预防了其他动画重蹈覆辙，改变全世界的动画制作界。
所以我们现在收看的神奇宝贝不仅热门，还是制作最严谨、最安全的动画之一呢!
